在水处理领域，亚硫酸钠用作锅炉水和油田注水的脱氧剂，市政用水或工业用水的脱氯剂。
废水处理中用于将六价铬盐还原成低毒的三价铬盐，并可以从废水中沉淀和分离银和汞等。
亚硫酸较多地用于中小型锅炉和压力低于5.88MPa下运行的锅炉，通常配成2%～10%的溶液。

亚硫酸钠的用量通常为0.076g/L。使用时 加入适量的催化剂，如Cu、Co、Mn、Ni的盐类，可提高除氧率。
在锅炉停止使用时，可用已除过氧并加有约200mg/L亚硫酸钠的碱性除氧水充满，以保护金属不受腐蚀。
从水中除去过量的游离氯时，亚硫酸钠应与亚硫酸氢钠或二氧化硫复配使用。
另外，作为油田采油注水的脱氧剂，只要加入10mg/L的亚硫酸钠，即可控制溶解氧对井管的腐蚀。
另外，亚硫酸钠在化工生产中用作生产硫代硫酸钠的原料，也是黏胶纤维的稳定剂，啤酒瓶的杀菌剂、玻璃镜子和石板的雕刻剂、织物漂白组分和脱氧剂、感光工业用显影剂等